Nenhuma possibilidade de cura foi até ao momento encontrada para a doença, apenas existem meios de aliviar os sintomas. O tratamento é altamente individualizado não havendo nenhum medicamento que actue igualmente em todos os doentes com cistite intersticial.
O tratamento pode consistir em drogas por via oral, intilações vesicais, distensão vesical, neuro-estimulação, terapêutica por laser ou ainda várias formas de cirurgia.
